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História[]
Krakoa era originalmente uma pequena ilha localizada no Oceano Pacífico, quando foram realizados vários testes nucleares em suas localidades. A radiação resultante alterou o DNA do ecossistema, transformando-o em um ser único, consciente e inteligente, com fome de energia.
Em sua primeira aparição, ela foi detectada como um mutante pelo computador Cérebro, o que fez com que Charles Xavier enviasse os X-Men Originais (Ciclope, Fera, Homem de Gelo, Garota Marvel e Anjo) e mais Polaris ao seu encontro. Chegando lá, eles são facilmente capturados pela entidade, que passa a se alimentar de suas energias.
Tencionando capturar mais mutantes, a ilha liberta Ciclope que, desorientado volta à Mansão X. Xavier então, toma uma decisão drástica: entra em contato com uma nova geração internacional de mutantes (que ele já estudava a tempos), tencionando montar uma força tarefa que salvasse seus alunos originais. Foram eles: Colossus, Noturno, Tempestade, Solaris, Pássaro Trovejante, Banshee e Wolverine.
Apesar da falta de entrosamento da equipe, eles voltam à ilha sob a liderança de Ciclope e, com os poderes conjuntos da Garota Marvel, Polaris, Tempestade e Ciclope, eles conseguem isolar a ilha para o espaço sideral. Após essa batalha, a equipe sofreu forte reformulação (com a saída da maioria dos membros originais), assumindo sua popularidade crescente até os dias atuais. Quanto à Krakoa, ela foi aparentemente capturada pela entidade cósmica conhecida como Estranho, tendo sido avistada pelo herói Quasar quando este visitou um dos seus "planeta-laboratório".
X-Men: Gênese Mortal
No ano de 2006 foi revelado nos quadrinhos que a equipe de resgate que deu origem à segunda geração de X-Men (Noturno, Wolverine, Pássaro Trovejante, Tempestade e Colossus) não foram os primeiros a irem à Krakoa. Um outro grupo (alunos de Moira McTaggert) havia sido mandado anteriormente, compunham esta equipe: Vulcano, Darwin, Reprise e Petra. As ações do Professor levaram este grupo a morte de Reprise e Petra. Isso deu continuidade à tendência de mostrar que a maioria das ações e planos do Professor Xavier nunca foram totalmente revelados aos X-Men.